四个教父被下人领去一座闲置的庭院居住后，郑成功叫人把卢若腾、曾樱、路振飞、王忠孝等几个主要文官手下都叫过来了。
等人到齐了，郑成功说道：“各位，之前我在澳门曾答应过一个神父，只要他们愿意帮我开设学院，我准许他们传播天主教。现在他们来了，我决定开设一所厦门格物学院。”
卢若腾听到忙说道：“大将军，敢问那格物学院都是学什么的？”
郑成功想了一下，组织文字说道：“格物学院主要是教授学生手工技术，以及引导他们对事物本源的精研细查。”
辜朝荐一听忙说道：“奇技淫巧，多乱人心智。大将军，此风不可涨！”
郑成功听到有人反对，将早已经想好的话说了出来，“当今乱世，正需要此等奇技淫巧以壮我军，驱使鞑虏！”
辜朝荐反对道：“立国之道，尚礼义不尚权谋，根本之图，在人心不在技艺。当以忠信为甲胄，礼义为干橹，抵御外侮。”
郑成功反斥道：“陈甚高，持论甚正。然鞑子可有礼义，可有忠信，大明可曾抵御住外诲。以礼义为干橹，以忠信为甲胄，无益于自强实际。为华夏计，当诚取西人器数之学，以卫吾尧、舜、禹、汤、文、武、周、孔之道。”
面对鞑子的入侵，很多士子文士都在深思到底是哪里出了问题，为什么大明会败亡？
很多文士为了抗清都纷纷弃文从武，亲自带兵作战。
现在听到郑成功搬出满清鞑子与大明的例子后，辜朝荐沉默了。
看到劝说住自己的手下，郑成功在厦门城东选取了一处大庭院作为厦门格物学院的校址。
在“以中国之伦常名数为原本，辅以诸国富强之术”为名下，郑成功“三顾茅庐”劝说宋应星放下对自己的成见，担任了厦门格物学院的院长一职，冯澄世做了教导主任。
格物教学对于明朝那些文士来说是奇技淫巧之术，难登大雅之堂。他们都不屑一顾，更加不懂，根本不能指望他们能教导什么格物了。
现在能教授格物的除了传教士，就是能识文学字的匠工了。
但这种匠工很稀少，远远满足不了学院的需求。
为了找到足够的老师，郑成功举良工，凡是能识字的能工巧匠，郑成功一律高价聘用。
请来了格物教师，那些教导四书五经传统文学的教师到是好找。
没几天，曾樱、卢若腾等人就安排了福建浙江等地几个童生秀才来格物学院教书了。
这几个童生秀才都是听从曾樱等人的劝说，来格物学院谋求一份生计。
郑成功一开始是给他们的束脩是每月三两五。
为了让更多良工来学院教书，郑成功给良工的束脩都是十两。
给这些童生秀才只有三两五，顿时招来了曾樱等人的强烈不满，认为郑成功这是在侮辱读书人，那些童生秀才都为此差点辞职了。
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